第9章如何SCI论文的实验材料和方法
%:2EoXN" 实验材料和方法(Materials and Methods)章节描述你是怎样来研究问题(How did you study the problem),包括:①你用了什么?(What did you use?)②实验过程?(How did you proceed?)
p4mi\~Q 1.实验材料和方法的重要性
5
.m&93P (1)科学成果必须是可重复性的。“实验材料和方法”章节的关键是保证他人可以重复你的结果,因为本章节描述你做了什么、怎么做和用了什么。
1P4cBw% (2)审核者常常仔细研究本章节。审稿者根据你提供的实验材料和方法来判断和决定后是否论文的结果可以信任。如果审稿者认为实验材料和方法有缺陷,则该论文的设计也有缺陷。其结果是该论文被拒绝。
h1}U#XV 因此,虽然实验材料和方法的写作相对较为简单,但是需要注意的问题不少,中啊哟的在于完整的描述。完整性就是实验当中的每一个环节都要注意到,不要顾此失彼,遗漏一些重要内容。
Loz
5[L 2. 实验材料和方法的主要内容
Hdvtgss! 实验材料和方法部分可以按以下三个方面来描述。
EQe !&; (1)你用了什么,包括:
KaVNRS ⊿实验对象(experimental subjects):一般是人、动物、植物或者一些组织等,他们的基本信息要描述明确。要注意SCI论文期刊大多对牵扯到人或动物的实验都是要动物委员会(Institutional Animal care and Use Committee, IACUC)或伦理委员会(Institutional review Boards, IRB)通过。详情链接网址:
http://grants.nih.gov/grants/olaw/GuideBook.pdf。和
http://www.hhs.gov/ohrp/irb/irb_guidebook.htm。方法学一定要做到:临床研究有病人知情同意书,通过伦理委员会批准;动物实验符合本人大学或者研究单位的动物管理与动物实验的章程等。因此,认真阅读投稿刊物中关于实验的详细规定。如果违反这一规定,可能会被不接受评审或发表。要描述实验动物的full binominal latin names、种系和来源。
z=mH\! 示例一 动物的实验描述
(-S<9u-r Animal model
` 9;0Y All surgical procedures postoperative care was performed in accordance with guidelines of the Yale Animal Care and Use Committee. Focal cortical ischesia was induced in male mice(8-10 weeks old)weighing 20-25gm by photothrombosis of cortical microvessels as described previously in detail (Boquillon et al.,1992;Schroeter et al.,2002).Each mouse was anesthetized with 25 isoflurane and maintained with 1% isoflurane in an oxygen/air mixture using a gas anesthesia mask in a stereotaxic frame(Stoelting, Wood Dale,IL).The recal temperature was controlled during surgery at 37±0.5℃ with a homeothermic blanket(Harvard Apparatus,Holliston,MA)…
w>#{Nl7gz 示例二 人体实验描述
)/HbmtX qI Human samples
"/e_[_j The experiments were carried out in accordance with the Declaration of Helsinki(2000) of the World Medical Association and the protocols approved by the Institutional Research Review Board at ×××Hospital of Beijing University,with informed consent…
(~>uFH
⊿实验材料(experimental materials):对材料的描述应清楚和详细。如果采用通用材料和通用方法,只需简单提及。例如,“Detail on calculating CBF have been described previously (reference)”或者“the CBF was calculated based on
pK` 1pfih The protocol as previously described (reference)”。如果采用有改进的特殊材料和实验方法,就应该较详细的加以说明。化学药品和实际的商业来源应该说明,但是公司地址不必说明,如“…poly-l-Lysine(Sigma#1309)”非商业来源的化学药品和试剂必须提供地址,如“The DCX antibody was kindly provived by Peter A.Rice(Buck Institute La Jolla,CA)”。
&T.d"i ⊿实验设备(experimental equipment):要对仪器型号、生产厂家、实验过程中的用途等作详细说明;设备使用时一些必要的的步骤不可省略,尤其是可能对实验结果造成特定影响的操作更要详细说明。这样做的好处是为了在Discussion章节中能够进行对应的分析。例如,一些设备在使用前要校正(calibration),有的要求每阶段试验之后都要重新校正,以保证结果的正确性。一定要详细说明你的操作步骤或校正过程,便于评审人分析你的结果的可靠性。
MB7UI8 示例三 实验设备和实验过程的方法写作
uqz HS>GM Apparatus
/q|r!+ NRI data were acquired at 1.5-T clinical MRI system(Signa,GE Medcial Systems)using the product head coil and foam cushions to minimize head movement. A standard 3D inversion recovery prepped T1-weighted spoiled gradient dcho(GE)sequence (echo time [TE]/repetition time [TR]=8.6/1.6ms;field of view [FOV] of 24mm, 1mm isotropic resolution)was acquire for anatomical localization and a CSF-nulled T2-weighted FLAIR sequence(TE/TR=11002/145ms,FOV 24mm,slice thinkness of 5mm,256x192matrix) was acquired to identify regions of prior cerebral infarction…
))T@U?r Stroke,2006,37:382-387
F}1h (2)实验过程(experimental procedures):对实验的整个操作流程描述要详略得当、重点突出。应遵循的原则是给出足够的细节信息以便让同行能够重复试验。如果方法新颖且不曾发表过,应提供所有必需的的细节;如果所采用的方法已经公开报道过,引用相关的文献即可。叙述时,不要罗列实验过程,而只叙述主要的、关键的。并说明使用不同于一般实验的的设备和操作方法,从而是研究成果的规范性更加鲜明。叙述实验经过,通常采用研究工作的逻辑顺序,而不按实验先后顺序,要抓住环节,,从复杂的事物中理出脉络,按其发展变化规律写。
8y:/!r
RN (3)结果的统计处理(How the data were analyzed?)。实验的结果需要进行统计处理时,要提供足够的信息,包括:
j1zrjhXI ⊿实验重复了几次,一般来说实验至少重复三次。
Lql2ry$Wa ⊿均值。
m:}PVJ-" ⊿标准误(SEM)或标准差(SD)。
T`?7z+2A ⊿统计分析的方法。
&}'FC7} ⊿P值(P value)。
1JQ5bB"
3.材料和写作方法的要点
zA%YaekJ (1)描述实验过程应遵循的原则是给出足够的细节信息以便让同行能够重复试验,避免混入有关结果或发现某些方面的内容。
G2$<Q+UYs? (2)写作时要详略得当。遵循的原则是:如果方法新颖且不曾发表过,应提供所有必要的细节;如果所采用的方法已经公开报道过,引用相关的文献即可。如果改进,可用“Briefly”“In brief”将改进的部分另加说明。
yj$$k~@ (3)药品和试剂的浓度,什么时候处理的、处理时间的长度等叙述也很重要,特别是当条件有变化时。
Vc[aNpE (4)可以用流程图进行说明实验过程。流程图的画法很多,有文字式的,有文字和示意图结合的,不同实验有不同做法。一般来说,可能后者多一些(实验性学科尤其如此),因为这样能使评审人对实验过程一目了然。如果示意图画得漂亮,还可以增加一些印象分。描述时要有鲜明的层次感,对每个步骤之间的顺序和关联要描述清楚,不要造成实验过程混乱不堪的印象。
ZLjEH7 (5)不要重复描述。
+3yG8 4.论文中常存在统计方法选择不当和应用不正确等问题
N#``(a (1)统计方法描述不清,结论欠科学。文中未交待所用统计方法或统计方法交代不清或根本不予交代,使读者对论文的正确与否无法判断。有的作者只提一句“经统计学处理”后,就写出结论。有的甚至直接用P值说明问题,笼统地以P>0.05或P<0.05、P<0.01便称结果差异有无显著性,P值的大小不说明差值的大小,它还与抽样误差大小有关。因此,还应该写明具体的统计方法,如有特殊情况,还应该说明是否采用了校正,应写出描述性统计量的可信区间,注明精确统计值(如t值、F值和u值等)和P值,然后根据P值大小做出统计学推测,并做出相应的专业结论。
{EfA#{x (2)﹡统计检验方法不正确。具体表现在:
H(hE;|q/ ◎t值检验用于多组资料比较。
&\>=4)HB; ◎成组t检验与配对t检验误用。
m?<^b_a} ◎对于偏态分布的数据采用t检验或方差分析。
&k@\k<2Ia ◎四格表的检验误用,构成比与率的误用,非正态分析资料用±SM方式来描述。
$u~*V 这些错误的方法必然导致错误的结论。正确的做法是配对设计的计量资料宜选用t检验。t检验和方差检验只能用于正态分布的数据中。当方差不齐时,应选用近似的t检验,若为大样本(n>50),可选用u检验。多组间均数比较时,如果资料呈正态分布,且方差呈齐性时,应该用方差分析(也叫ANOVA分析,或F检验)。要研究某两个或某几个总体均数是否相等,还要在方差分析的基础上,进一步做两两比较的q检验(也叫Student-Newman-Keuls检验法)。当多个观察组与一个对照组进行均数间比较时,应作Dunnett t检验。
eo@kn yA<& 5.材料和方法写作时态的应用
H#S`m (1)若描述的内容为不受时间影响的事实,则才用一般现在时。
t$Bu<frQ (2)如描述的内容为特定、过去的行为或事件,则采用过去时。
KqN;a i,F (3)方法章节的焦点在于描述实验中所进行的每个步骤以及所采用的材料。由于所涉及的行为与材料是讨论的焦点,而且读者已指导进行这些行为和采用这些材料的人就是作者自己,因而一般都习惯采用被动语态。
C'y4 ~7 (4)如果涉及表达作者的观点或看法,则应采用主动语态。
T@Bu Fr`]< (5)力求语法正确、描述准确。由于材料和方法部分通常需要采用很简洁的语言,使用精确的英语描述材料和方法是十分重要的。需要注意的方面通常有:
kwXUjnp ⊿不要遗漏动作的执行者。
cP",szcY ⊿在简单表达的同时要注意内容方面的逻辑性。
n^q%_60H ⊿如果有多种可供选择的方法能采用,在引用文献时提及一下具体的方法。
GlHP`&;UH ⊿普通、简单的过程不必详述。
?8do4gT+1 ⊿避免使用含糊不清的描述。
P BVF'~f@j